Знаменитый клуатр, то есть внутренний двор, — это практически все, что осталось от большого бенедиктинского монастыря, построенного в конце XII века одновременно с собором, с его солнечной стороны. Клуатр представляет собой квадрат с длиной стороны 47 метров. А его 228 изящных колонн, 208 из которых расположены попарно, поддерживают стрельчатые арки — их по 26 на каждой стороне. Двойной волнистый фриз над арками украшен инкрустациями из лавового камня и известняка, образующими двухцветный мотив. Еще выше идет декоративная горизонтальная полоска, которая повторяет тот же мотив с несколькими изысканными вариациями.
Изящество небольших колонн подчеркивается разнообразием форм и узоров: колонны здесь гладкие, витые, с узором в виде зигзага, с мозаичными инкрустациями, с золочеными вставками и вставками из стекломассы, при этом все узоры отличаются друг от друга. Некоторые капители были явно выполнены в спешке, и над ними трудились не очень опытные мастера. Возможно, требовалось быстро закончить работы. Однако, другие капители представляют собой высокохудожественные произведения: легкие и элегантные, либо массивные и украшенные богатой резьбой, они образуют самое большое собрание образцов романской скульптуры на Сицилии.
Сюжеты для резьбы на капителях в основном взяты из античности, но рядом с ними часто изображаются и мифические существа, библейские эпизоды или даже сцены из повседневной жизни: охота, жонглирование, сельскохозяйственные работы, праздники. Мы видим многочисленные изображения реально существующих растений и животных, а рядом с ними — фантастических созданий, а также библейских или мифических персонажей. Это непредсказуемое чередование различных сцен и стилей без следования какому-либо плану вызвано тем, что здесь работали мастера и подмастерья, являвшиеся представителями разных художественных школ и обладавшие разными способностями.
В одном из углов клуатра находится прекрасный фонтан, огражденный образующей квадрат небольшой колоннадой. На цилиндрическом основании покоится круглая чаша, из которой поднимается стилизованный ствол пальмы с горизонтальным зигзагообразным узором. Бутон на вершине украшают шесть танцоров, чередующихся с таким же количеством музыкантов. Непосредственно над этими фигурами расположены 12 львиных и человеческих голов, из которых вытекает вода. А самый верхний уровень бутона выполнен в виде больших листьев.
Любопытный факт: фонтан был построен не в качестве декоративного сооружения — первоначально он служил монахам для умывания и мытья рук.
