L'église supérieure d'Assise est un espace qui respire une atmosphère complètement différente de l'église inférieure. C'est un espace plus grand, où de nombreux vitraux diffusent une lumière chaude, changeante et mystique. L'église supérieure symbolise la vie éclairée par la foi, tandis que l'église inférieure représente l'expérience terrestre, sombre et douloureuse. Ces deux églises superposées racontent le chemin de l'existence humaine et soulignent l'importance de l'acceptation volontaire et joyeuse du sacrifice pour atteindre la joie absolue. Les fresques situées dans l'église supérieure à Assise racontent la vie de saint François et sont considérées comme certaines des peintures les plus célèbres de tout le Moyen Âge. Des artistes renommés tels que Cimabue et Giotto y ont travaillé.
