Dans la cinquième chapelle sur le côté gauche de l'église vous pouvez voir les trois chefs-d’œuvre du Caravage.
La décision de confier au Caravage une série de tableaux sur la vie de saint Matthieu fut courageuse. L’artiste n’avait que 28 ans et il n’avait peint jusque-là que des toiles de dimensions moyennes avec peu de personnages et jamais de sujets religieux : ce fut sa première commande publique qui marquera un net tournant dans son art. Il s’agissait de réaliser le retable et de peindre des fresques sur les murs de la chapelle, inachevée depuis des années, de la famille du cardinal Contarelli.
Caravage, qui n'aimait pas du tout peindre des fresques, introduisit une innovation : au lieu des peintures murales habituelles, il décora les murs avec deux grandes peintures narratives intitulées la Vocation de saint Matthieu et le Martyre. Cette nouveauté connut un succès immédiat.
Le Caravage peignit tout d’abord Saint Matthieu et l’ange, mais lorsque les clients virent ce saint à l’expression grossière d’un paysan semi-analphabète avec de gros pieds calleux présentés au premier plan, ils renvoyèrent l’œuvre à l’expéditeur en lui disant de la refaire.