Les cellules des frères, numérotées de un à trente-neuf, ont été organisées par Michelozzo dans le couvent. Elles sont reliées par de longs couloirs qui courent le long des trois côtés du cloître. Les cellules sont décorées de fresques de Fra Angelico et de ses élèves, exécutées juste avant 1450. Les fresques racontent des scènes inspirées de l'Évangile et sont réparties dans les cellules et les couloirs. Cet arrangement crée un parcours enchanteur pour les visiteurs.
