L’imperatore Meiji, molto amato dai giapponesi, è il sovrano che ha spostato la capitale del Giappone a Tokyo, che è stato il principale artefice della modernizzazione del paese e colui che lo ha spinto a diventare una grande potenza economica mondiale.
Dopo la sua morte, nel 1912, il parlamento giapponese approvò una risoluzione per commemorarne l’importanza con un santuario e fu scelto come sito un giardino di iris che l'Imperatore Meiji e la moglie visitavano spesso.