La Sala Capitolare, alcune celle del convento e il sontuoso salone dei re ospitano il Museo del convento, un tesoro d’arte che dimostra ampiamente la ricchezza del palazzo e l’origine aristocratica di molte monache: reliquiari, mobili, grandi arazzi, sculture e opere di grandi pittori del ’500 e ’600, fra cui Tiziano e Zurbarán.